تجسيدا لرسالتها التعليمية الوطنية، بدأت جامعة النجاح الوطنية خطوتها الأولى في مسار الدراسات العليا في العام 1982 بطرح عدد من برامج الماجستير في العلوم التربوية، استجابة حتمية لحاجة المجتمع الفلسطيني في ذلك الوقت إلى فئة من الشباب الفلسطيني المؤهل والمتخصص لقيادة قطاع التعليمي المدرسي في فلسطين، والحفاظ على الهوية الوطنية العربية الفلسطينية في ظل الاحتلال الاسرائيلي وما صاحبة من ظروف اقتصادية قاسية مر بها مجتمعنا الفلسطيني، الأمر الذي لم ُيمكن مادياً الغالبية العظمى من حملة البكالوريوس من الجامعات الفلسطينية من مواصلة تعليمهم العالي خارج الوطن.
واستمرار لهذا النهج لجامعة النجاح الوطنية وتمشيا مع أهدافها المتمثلة في رفد المجتمع الفلسطيني بكوادر فنية وعلمية مؤهلة في العديد من المجالات العلمية، تم في العام 1995 تأسيس كلية الدراسات العليا كي تصبح كلية قائمة بذاتها.
تسعى الكلية إلى توثيق روابط التعاون الأكاديمي والبحثي ما بين كليات الجامعة وأقسامها المختلفة في المجالات التي تخدم المجتمع الفلسطيني، بالاضافة التي تعميق أواصر التعاون العلمي مع الجامعات الفلسطينة الأخرى.